重庆工商大学融智学院是经教育部批准设立的独立学院。2001年由重庆商学院申报成立并于当年招生（《重庆市教育委员会关于同意设立重庆商学院融智学院的批复》渝教高〔2001〕16号）。2002年重庆商学院与渝州大学合并为重庆工商大学，重庆商学院融智学院随之更名为重庆工商大学融智学院，2003年12月经教育部（《教育部关于对重庆市普通高等学校举办的独立学院予以确认的通知》教发函〔2003〕541号）批准为全日制本科层次的独立学院。2011年增列为学士学位授权单位。2016年获批为重庆市第二批整体向应用型转变试点高校（〔2016〕12号）。2020年经教育部批准转设为独立设置的非营利性民办普通本科高等学校。

学校成立以来，办学地址搬迁两次。2001-2004级学生均在重庆工商大学五公里校区就读；2005级开始，学生入学就读于沙坪坝区井口镇先锋街校区（原重庆工商大学C区)；2015年，学校整体搬迁入驻巴南新校区（重庆市巴南区龙洲湾街道尚文大道906号）。